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dna限制性内切酶消化的

编辑:chaxungu时间:2022-09-28 08:34:43分类:数理化学

目录·[原理]
·[操作]
·[注定事项]
·[试剂和器材]


[原理]
dna限制性内切酶消化是基因分析中的关键步骤。内切酶是最关键的工具酶。限制性内切酶是一类具有严格识别位点,并在识别位点内或附近切割双链dna的脱氧核糖核酸酶。

酶单位规定为:在最适反应条件下1小时完全消化lμgλdna的酶量为1个单位。需注意酶单位数是以切割线性dna为标准定出的。消化其它种dna则应根据dna分子大小、形状适当增加或减少所需的酶量,影响限制性内切酶活性的因素包括dna的纯度、缓冲液、温度及酶本身。不同的限制性内切酶对缓冲液中盐浓度的要求各不相同。一般配制高、中、低盐3种缓冲液,用于酶反应。dna甲基化,附有蛋白质或高分子量dna胶体溶液太粘稠均会降低内切酶的消化效率。由于在限制性内切酶消化反应中,甘油浓度超过5%(v/v)会抑制内切酶活性,因此在20μl反应体系中,甘油浓度应少于lμl。用2种酶消化dna时,各种酶所需盐浓度相同,则消化可同时进行;若需要的盐浓度不相同,则必须先用低盐浓度的限制性内切酶消化完后,再调整到高盐缓冲系统,加入高盐浓度的限制性内切酶,继续消化。

一定的dna分子的核苷酸顺序是一定的,某种限制性内切酶作用于该dna的切点数一定,故所得的dna片段数和片段的大小也一定,通过琼脂糖凝胶电泳或聚丙烯酸胺凝胶电泳分离,以标准dna(λdna/hindⅢ或λdna/ecori)作对照,溴化乙锭染色后,测出各dna片段移动的位置和距离。以各标准dna片段的分子量对数为纵坐标,各标准dna片段的移动距离为横坐标,求出各样品dna片段的分子大小。

[操作]
l.样品dna的限制性内切酶消化

(1)取2μg样品dna溶液加入0.5ml的eppendorf管中,加2μl10×限制性内切酶缓冲液,6~10个u的相应限制性内切酶,加消毒双蒸水至总体积20μl,于37℃保温酶解2小时,按上述条件用适当的几种不同的内切酶进行单酶或双酶解。

(2)在65℃加热5分钟或用适量的0.5mol/ledtana2终止反应。

2.dna酶解片段的电泳分离

取dna酶解作品2μl加上样缓冲液10μl(含溴酚蓝指示剂和甘油),在0.8%琼脂糖(含0.5μg/ml溴化乙锭)凝胶进行水平电泳,电压<5v/cm,时间2小时左右,用紫外灯观察分析。

[注定事项]
1.分子克隆是微量操作技术,dna样品与限制性内切酶的用量都极少,必须严格注意吸样量的准确性及全部放入反应体系中。

2.要注意酶切时加样的次序,一般次序为水、缓冲液、dna各项试剂,最后才加酶液。取液时,tip头要从溶液表面吸取,以防止tip头沾去过多的液体与酶,待用的内切酶要放在冰浴内,用后盖紧盖子,立即放回-20℃冰箱,防止限制性内切酶的失活。

3.凡用在酶切反应中的一切塑料器皿(eppendorf管,tip头等),都要新的,最后用重蒸水清洗,湿热灭菌,置50℃温箱中烘干,使用前打开包装,用镊子夹取,不直接用手去拿,严防手上杂酶污染。

4.当样品在37℃与65℃保温时,要注意:

(l)防止因盖子未盖严密使水汽进入管内,使反应溶液体积大量增加,造成实验失败。

(2)防止由于标签脱落,分不清样品类型。

5.由于温差原因,往往在盖上有水汽,因此样品酶切完毕或中间取样电泳要离心2秒钟,以集中体积内溶液,否则会发现酶切后体积少了。

[试剂和器材]
1.试剂

(1)限制性内切酶:如ecori、hindⅢ、pstⅡ、bamh1等,-20℃贮存。

(2)样品dna:如λdna、pbr322等,-20℃贮存。

(3)限制性内切酶缓冲浪配制,见下表(用消毒双蒸水配制,贮存于-20。c);
(4)10×tbe电泳缓冲液:0.89mol/ltris;0.89mol/l硼酸;0.02mol/ledtana2ph8.0,高温灭菌,贮存于4℃。

(5)6×上样缓冲液:0.25%溴酚蓝;40%蔗糖;用消毒双蒸水配制,贮存于4℃。

(6)溴化乙锭溶液:称取溴化乙锭5mg溶解于lml消毒双蒸水中,4℃避光保存。

(7)消毒双蒸水。

2.器材

恒温水温箱;电泳仪;水平电泳糟;50μl可调移液器;紫外灯(上海康华生化仪器制造厂)。


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