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中红外区在红外光谱分析中应用最广，该区又分为官能团区(或称特征频率区，4000～1330cm-1)和指纹区(1330～400cm-1)。指纹区的红外吸收光谱很复杂，能反映分子结构的细微变化。每一种有机化合物在该区谱带的位置、强度和形状均不相同，如人的指纹一样，可用于认证有机化合物。此外，该区还有一些特征吸收峰，有助于鉴定官能团。