迄今，植物病原细菌的主要类群有14个属，除土壤杆菌(agrobacterium)、欧文氏菌属(erwinia)、假单胞菌属(pseudomonas)、黄单胞菌属(xanthomonas)和链丝菌属(streptomyces)之外，革兰氏阴性菌增加了嗜酸菌属(acidovorax)、根杆菌属(rhizobzcter)、根单胞菌属(rhizomonas)、嗜木质菌属(xylophilus)、泛生菌属(pantoea)和木质部小菌属(xylella)等；革兰氏阳性细菌则有棒形杆菌属（clavibacter）、节杆菌属(arthrobacter)、短小杆菌属(curtobacter)、红球菌属(rhodococxcus)和芽孢杆菌属(bacillus)等。1992年以来，植物病原细菌又增加了布克氏菌属和韧皮部杆菌属等