氢噬胞菌属拉丁学名(hydrogenophagawillamsetal.，1989)直或稍弯的杆状，大小为0.3～0.6μm×0.6～5.5μm，单个或成对存在。以一根极毛运动，罕见2根极生到亚极生鞭毛。细胞呈革兰氏阴性。氧化酶阳性，接触酶反应因种而异。产非水溶性黄色素。好氧。兼性嗜氢自养菌。以氧为末端电子受体的氧化型的糖代谢。有的种(类黄氢噬胞菌h.pseudoflava和螺纹氢噬胞菌h.taeniospiralis)具有厌氧硝酸盐呼吸，具反硝化作用。能在含有机酸、氨基酸或蛋白胨的培养基上良好生长，但很少利用碳水化合物。有环丙烷基脂肪酸(17∶环)；单独有3-羟基辛酸(3-oh-8∶0)或与3-羟基癸酸(3-oh-10∶0)一起存在。而无2-羟基结构的脂肪酸。荼醌q-8为主要呼吸醌。dna的g+c含量为65～69mol％。模式种：黄色氢噬胞菌(hydrogenophagaflava)。已报道有4个种，它们的鉴别见表4-27。