存在于蘑菇菌丝附近的各种微生物称为菌际微生物或菌丝周围微生物(hyphospheremicroorganisms)，它们处于每条菌丝的周围。thornton(1953)首先采用hyphosphere这一术语。winter等(1960)也发现在天然基质中的蘑菇菌丝周围也有一个类似在植物根际一样的微生物环境，即菌际微生物。关于菌际微生物作用的研究材料还很少。第一个有关长了蘑菇菌丝的堆肥中细菌变化的材料是在1967年。随后stanek［18］，fergus［19］研究蘑菇菌际微生物后发现：当蘑菇菌丝在堆肥中定植时，堆肥中的细菌和真菌(包括纤维素分解菌、耐酸菌、耐热细菌)的总数目降低了，而耐链霉素的细菌数目却增高了。用rossi-cholodney法研究堆肥中蘑菇菌丝周围各种微生物位置，结果发现：革兰氏阳性细菌的小菌落沿着每条蘑菇菌丝而存在着，其特性不同于无蘑菇菌丝的堆肥中存在的细菌。从蘑菇菌丝周围分离出来的细菌90%以上属于假单孢细菌(pseudomonas)，其中耐链霉素细菌占相当大的比例。它们的培养滤出液绝大多数都能促进蘑菇菌丝的生长，处理后蘑菇菌丝平均干重比对照高37%，蘑菇菌丝与其周围细菌的各自培养滤出液相互有刺激作用，这表明它们之间有一定的相互作用，这种有益的作用可以促使蘑菇菌丝更快地在堆肥中定植萌发和生长。蘑菇菌丝周围微生物的存在和活动性是蘑菇菌丝在堆肥中生长之后创造出来的环境所引起的。