现有能稳定遗传的紫茎（R）缺刻叶（E）和绿茎（r）马铃薯叶（e）两个番茄品种，控制这两对相对性状的基因符合孟德尔的遗传定律。请根据要求完成下列问题：

（1）R基因能控制紫茎性状的原因是 。

（2）在开花时，对稳定遗传的紫茎马铃薯叶个体的花粉进行射线处理，让其自交，然后将获得的种子种植，出现了紫茎缺刻叶的番茄，其原因是 。

（3）某班同学欲对（2）中得到的紫茎缺刻叶的番茄种子进行基因组成的鉴定，第一组计划用单倍体育种方法进行实验，第二组计划用测交法进行实验，第三组的同学认为前两组的实验方案较为繁琐，于是设计了一个更加简便易行的实验方案。如果你是第三组的成员，请按要求完成下列实验方案。

探究方法：

实验步骤：

①取所需种子播种并进行苗期管理。

②植株开花时， 。

③对每株植株的上述两种性状进行统计分析。

预期实验现象及结论：

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（1）R基因通过控制与色素合成有关酶的合成来控制茎性状

（2）射线造成花粉中控制马铃薯叶的基因发生突变

（3）探究方法：自交法

实验步骤②：让其自花授粉

预期实验现象及结论：

若全部是紫茎缺刻叶，说明种子的基因组成为RREE；

若有紫茎缺刻叶和紫茎马铃薯叶两种，比例接近3：1，说明种子的基因组成为RREe；

若有紫茎缺刻叶和绿茎缺刻叶两种，比例接近3：1，说明种子的基因组成为RrEE；

若有紫茎缺刻叶、紫茎马铃薯叶、绿茎缺刻叶、绿茎马铃薯叶四种，比例接近9:3:3:1，说明种子的基因组成为RrEe。