等位基因存在于同源染色体的相同位置上，控制相对性状。四分体是细胞减数分裂过程中由成对同源染色体联会后，含有4条染色单体的结构，可能有等位基因存在；非同源染色体上不存在等位基因，染色体组内的染色体都是非同源染色体。