A.实验1在黑暗条件下进行，属于对照组，实验2在光照条件下进行，属于实验组B.1是水绵细胞，2是培养液，此过程中，水绵一定要保持正常的生命活性C.利用此实验装置，可以验证线粒体是呼吸作用的场所D.1结构内不含与有氧呼吸相关的酶，2处的好氧菌含与有氧呼吸相关的酶在线课程D
试题分析：本实验是对比实验，实验1和实验2都是实验组，A错误； 1是水绵细胞内的叶绿体，不是水绵细胞，2是水绵细胞的细胞质基质，不是培养液，B错误；利用此实验装置，不能验证线粒体是呼吸作用的场所，C错误；l是叶绿体，不含与有氧呼吸有关的酶，好氧菌能进行有氧呼吸，具有与有氧呼吸相关的酶，D正确。故选D。
考点：本题考查细胞结构的知识和对恩格尔曼经典实验的认识，意在考查学生运用生物学知识分析现象的能力。